ABSTRACT
Entre as aplicações do mapeamento genômico está a procura por loci de caracteres quantitativos, influenciando características economicamente importantes na produção animal. A metodologia identifica relações entre variações no nível do DNA e valores fenotípicos. Esses dados fenotípicos podem ser referentes à características de herança simples ou quantitativa (herança poligênica). Em anos recentes, análises têm sido focadas, principalmente em caracteres quantitativos, pois são a base das características de produção. No entanto, a natureza poligênica desses caracteres com variação contínua dificulta análises clássicas, por meio de cruzamento para isolamento gênico, principalmente em razão da falta de segregação fenotípica discreta. Nesses casos, regiões do DNA responsáveis pelo fenótipo são definidas como QTL (Quantitative Trait Loci). Sua identificação pode ser realizada por varredura genômica ou análise de cromossomos individualmente. Um próximo passo é identificar os genes presentes nas regiões próximas a marcadores ligados ao QTL. O procedimento é realizado por meio de mapeamento fino, com o emprego de um maior número de marcadores próximos a região de localização do QTL. Este refinamento da análise de ligação, ou saturação da região de mapeamento, permite reduzir o tamanho da região mapeada, e, portanto, reduzir o número de possíveis genes relacionados ao QTL...
Among the applications of genome mapping is the search for loci that influence economically important quantitative traits in animal production. The methodology identifies the relationship among variations at DNA level and phenotypic values. These phenotypic data may be referent to traits of simple or quantitative (polygenic) inheritance. In recent years, analyses have been mainly focused in quantitative traits, since these are usually production traits. However, the polygenic nature of these particular characters with continuous variation makes it difficult to employ classical analyses of crosses for gene isolation, mainly due to the lack of discrete phenotypic segregation. In these cases, DNA regions responsible for the phenotype are defined as QTL (Quantitative Trait Loci). Its identification can be done by a whole-genome screening or analyzing chromosomes individually. A next step is to identify the genes present in the regions next to markers linked to QTL. The procedure is done by fine mapping, using a larger number of markers next to the region of the QTL position. This refinement of the linkage analysis or saturation of the mapping region allows reducing the size of the mapped region and thus reduce the number of possible genes related to the QTL...
Entre las aplicaciones del mapeo genómico está la búsqueda por loci de caracteres cuantitativos, influenciando características económicamente relevantes en la producción animal. La metodología identifica relaciones entre variaciones a nivel del ADN y valores fenotípicos. Esos datos fenotípicos pueden ser referentes a las características de herencia simple o cuantitativa (herencia poligénica). En años recientes, análisis han sido enfocadas, principalmente en caracteres cuantitativos, pues son la base de las características de producción. Sin embargo, la naturaleza poligénica de esos caracteres con variación continua dificulta análisis clásicos, que utiliza cruzamientos para aislamiento génico, principalmente en razón de la falta de segregación fenotípica discreta. En esos casos, regiones del ADN responsables por el fenotipo son definidas como QTL (Quantitative Trait Loci). Su identificación puede ser realizada por barredura genómica o por análisis individual de cromosomas. Un próximo paso es identificar los genes presentes en las regiones próximas a los marcadores unidos al QTL...
Subject(s)
Animals , Fisheries , Chromosome Mapping/veterinary , Selection, Genetic , FishesABSTRACT
ôPrimersö de locos SSR (Single Sequence Repeats) desenvolvidos a partir de tilápia (Oreochromis niloticus) (UNH104, UNH108 e UNH160) e de Tropheus moorii (TmoM27) foram testados em alguns ciclídios brasileiros. Destes microssatélites avaliados, somente o TmoM27 apresentou amplificação para os gêneros Geophagus e Crenicichla (Cichlidae). Esse loco foi monomórfico em Crenicichla iguassuensis e nos morfotipos Crenicichla sp1 e sp2, com um tamanho estimado da ordem de 346 pb. Pelo menos nesse segmento de DNA não há diferenciação entre C. iguassuensis e as supostas sp1 e sp2. A espécie Geophagus brasiliensis apresentou, contudo, dois alelos com tamanhos de 346 e 358 pb. O menor alelo de G. brasiliensis correspondia ao alelo encontrado nas populações de Crenicichla, contudo sua identidade de bases não foi estabelecida. Observou-se equilíbrio de Hardy-Weinberg para o loco TmoM27, tanto em G. brasiliensis como em Oreochromis niloticus. O loco TmoM27 apresentou o mesmo nível de polimorfismo obtido por outros pesquisadores que analisaram este microssatélite nas espécies de Crenicichla saxatilis e Oreochromis niloticus. O locus TmoM27 pode ser usado para análise da heterozigosidade em Geophagus brasiliensis. Os locos UNH 104, UNH108 e UNH160 não tem aplicação em estudos de estrutura de populações para Crenicichla e Geophagus, pois nenhum produto de amplificação foi obtido nestas espécies.